Aprovechamiento de la genómica funcional para revelar nuevas dianas para el tratamiento del cáncer

Resultado esperado:

Las propuestas bajo este tema deben tener como objetivo ofrecer resultados que estén dirigidos y adaptados a, y que contribuyan a, todos los siguientes resultados esperados:

• Los investigadores y profesionales de la salud obtienen una comprensión más profunda de los efectos funcionales de la heterogeneidad tumoral durante el inicio y la progresión del cáncer, apoyando la identificación de dianas terapéuticas más precisas y novedosas.
• Los investigadores, profesionales de la salud e innovadores se benefician de un mejor conocimiento y herramientas para apoyar el descubrimiento y desarrollo de tratamientos contra el cáncer de próxima generación basados en la genómica.
• Los investigadores, innovadores y profesionales de todas las disciplinas y sectores contribuyen a la plataforma de datos de investigación UNCAN.eu asegurando la interoperabilidad de los datos y permitiendo el acceso sostenible a herramientas y modelos digitales recientemente desarrollados para el análisis y la gestión de datos clínicos multimodales.

Alcance:

El tema propuesto contribuirá al objetivo de la Misión de la UE contra el Cáncer de mejorar la comprensión del inicio y la progresión del cáncer. De particular interés para este tema son los cánceres pediátricos y adolescentes^[1], los cánceres con opciones de tratamiento limitadas, los cánceres refractarios, los cánceres raros o los tipos de cáncer con bajas tasas de supervivencia a cinco años. Las propuestas pueden incluir el diseño de estudios mecanicistas exploratorios utilizando biomuestras longitudinales de pacientes, estudios de prueba de concepto clínicos y/o estudios observacionales y traslacionales que involucren datos recién recopilados o existentes, según corresponda. Se anima a los solicitantes a aprovechar los avances tecnológicos en genómica funcional^[2] y biología estructural, incluyendo, entre otros, la secuenciación rápida de genes, estudios de una sola célula, mapeo genético espacial, transcriptómica espacial, perfilado epigenético, biopsias líquidas y pipelines de oncología de precisión funcional. Se fomenta el uso de inferencia causal, modelado computacional y/o herramientas de inteligencia artificial para la recopilación, visualización, análisis y gestión de conjuntos de datos grandes, complejos y heterogéneos. Se prevé la colaboración entre diferentes disciplinas científicas, incluidos los profesionales de la salud^[3].

Los solicitantes deben abordar todas las siguientes actividades:

• Identificar y validar nuevas dianas para enfoques terapéuticos innovadores, desarrollando modelos experimentales^[4] y tecnologías para acceder a los efectos funcionales de la heterogeneidad temporal del tumor en el inicio, progresión y recaída de la enfermedad.
• Investigar los mecanismos subyacentes a la interacción entre las características multiómicas dinámicas del tumor, su microambiente y los factores específicos del paciente^[5] durante el inicio y la progresión de la enfermedad. Esto incluye dilucidar los mecanismos de resistencia adaptativa a las terapias, utilizando datos clínicos cuando sea apropiado^[6].
• Aplicar enfoques, herramientas y modelos de última generación para integrar y analizar datos de pacientes longitudinales multimodales FAIR (Encontrables, Accesibles, Interoperables, Reutilizables). Estos activos digitales deben ponerse a disposición a través de la plataforma de investigación UNCAN.eu. Todos los conjuntos de datos producidos deben describirse con registros de metadatos en el catálogo de conjuntos de datos de la UE del Espacio Europeo de Datos Sanitarios. La participación de las infraestructuras de investigación ESFRI existentes que ofrecen recursos de ciencias de la vida^[7], incluidas las opciones de biobancos, debe reflejarse adecuadamente en el plan de trabajo de la propuesta.

Se debe aprovechar al máximo los datos y la experiencia obtenidos en el marco de iniciativas a gran escala actuales como: el proyecto europeo 1M+ Genomes^[8] y la iniciativa europea de imágenes de cáncer^[9] y otras según corresponda. Se espera que las propuestas exitosas establezcan colaboraciones apropiadas con el proyecto UNCAN-CONNECT que está implementando la plataforma de investigación UNCAN.eu^[10]…