Nutzung der funktionellen Genomik zur Entdeckung neuer Ziele für die Krebsbehandlung

Erwartetes Ergebnis:

Vorschläge zu diesem Thema sollten darauf abzielen, Ergebnisse zu liefern, die auf alle der folgenden erwarteten Ergebnisse ausgerichtet und zugeschnitten sind und dazu beitragen:

• Forschende und medizinisches Fachpersonal gewinnen ein tieferes Verständnis der funktionellen Auswirkungen der Tumorheterogenität während der Krebsentstehung und -progression, was die Identifizierung präziserer und neuartiger therapeutischer Ziele unterstützt.
• Forschende, medizinisches Fachpersonal und Innovatoren profitieren von verbessertem Wissen und Werkzeugen zur Unterstützung der Entdeckung und Entwicklung von genomisch informierten Krebsbehandlungen der nächsten Generation.
• Forschende, Innovatoren und Fachleute aus verschiedenen Disziplinen und Sektoren tragen zur UNCAN.eu-Forschungsdatenplattform bei, indem sie die Dateninteroperabilität sicherstellen und den nachhaltigen Zugang zu neu entwickelten digitalen Werkzeugen und Modellen für die Analyse und Verwaltung multimodaler klinischer Daten ermöglichen.

Umfang:

Das vorgeschlagene Thema wird zum Ziel der EU-Krebsmission beitragen, das Verständnis der Krebsentstehung und -progression zu verbessern. Von besonderem Interesse für dieses Thema sind pädiatrische und adoleszente Krebserkrankungen^[1], Krebserkrankungen mit begrenzten Behandlungsmöglichkeiten, refraktäre Krebserkrankungen, seltene Krebserkrankungen oder Krebsarten mit niedrigen Fünf-Jahres-Überlebensraten. Vorschläge können die Gestaltung explorativer mechanistischer Studien unter Verwendung longitudinaler Patientenbioproben, klinische Proof-of-Concept-Studien und/oder Beobachtungs- und Translationsstudien mit neu gesammelten oder bestehenden Daten umfassen, je nach Eignung. Antragsteller werden ermutigt, technologische Fortschritte in der funktionellen Genomik^[2] und der Strukturbiologie zu nutzen, einschließlich, aber nicht beschränkt auf schnelle Gensequenzierung, Einzelzellstudien, räumliche Genkartierung, räumliche Transkriptomik, epigenetische Profilierung, Flüssigbiopsien und funktionelle Präzisionsonkologie-Pipelines. Die Verwendung von kausaler Inferenz, computergestützter Modellierung und/oder Werkzeugen der künstlichen Intelligenz wird für die Sammlung, Visualisierung, Analyse und Verwaltung großer, komplexer und heterogener Datensätze gefördert. Die Zusammenarbeit zwischen verschiedenen wissenschaftlichen Disziplinen, einschließlich des Gesundheitspersonals, ist vorgesehen^[3].

Antragsteller sollten alle folgenden Aktivitäten berücksichtigen:

• Identifizierung und Validierung neuer Ziele für innovative therapeutische Ansätze durch die Entwicklung experimenteller Modelle^[4] und Technologien, um die funktionellen Auswirkungen der zeitlichen Tumorheterogenität auf Krankheitsentstehung, -progression und -rezidiv zu untersuchen.
• Untersuchung der Mechanismen, die dem Zusammenspiel zwischen den dynamischen Multi-Omics-Merkmalen des Tumors, seiner Mikroumgebung und patientenspezifischen Faktoren^[5] während der Krankheitsentstehung und -progression zugrunde liegen. Dies beinhaltet die Aufklärung der Mechanismen der adaptiven Resistenz gegenüber Therapien, wobei klinische Daten gegebenenfalls genutzt werden^[6].
• Anwendung modernster Ansätze, Werkzeuge und Modelle zur Integration und Analyse von FAIR (Findable, Accessible, Interoperable, Reusable) multimodalen longitudinalen Patientendaten. Diese digitalen Assets sollten über die UNCAN.eu-Forschungsplattform zur Verfügung gestellt werden. Alle erzeugten Datensätze sollten mit Metadaten im EU-Datensatzkatalog des Europäischen Gesundheitsdatenraums beschrieben werden. Die Einbeziehung bestehender ESFRI-Forschungsinfrastrukturen, die Life-Science-Ressourcen^[7] einschließlich Biobanking-Optionen anbieten, sollte im Arbeitsplan des Vorschlags angemessen berücksichtigt werden.

Es sollte, soweit möglich, von Daten und Erfahrungen profitiert werden, die im Rahmen aktueller Großinitiativen wie: dem European 1M+ Genomes^[8] und der European Cancer Imaging Initiative^[9] und anderen, je nach Bedarf, gewonnen wurden. Von erfolgreichen Vorschlägen wird erwartet, dass sie geeignete Kooperationen mit dem Projekt UNCAN-CONNECT aufbauen, das die UNCAN.eu-Forschungsplattform implementiert^[10]…