Kanser tedavisinde yeni hedefleri ortaya çıkarmak için fonksiyonel genomikten yararlanmak

Beklenen Sonuç:

Bu konu kapsamındaki teklifler, aşağıdaki beklenen sonuçların tümüne yönelik ve bunlara katkıda bulunan sonuçlar sunmayı hedeflemelidir:

• Araştırmacılar ve sağlık profesyonelleri, kanser başlangıcı ve ilerlemesi sırasında tümör heterojenliğinin fonksiyonel etkileri hakkında daha derin bir anlayış kazanarak, daha kesin ve yeni terapötik hedeflerin belirlenmesini destekler.
• Araştırmacılar, sağlık profesyonelleri ve yenilikçiler, yeni nesil genomik tabanlı kanser tedavilerinin keşfedilmesi ve geliştirilmesini desteklemek için geliştirilmiş bilgi ve araçlardan faydalanır.
• Araştırmacılar, yenilikçiler ve farklı disiplin ve sektörlerden profesyoneller, veri birlikte çalışabilirliğini sağlayarak ve çok modlu klinik verilerin analizi ve yönetimi için yeni geliştirilen dijital araçlara ve modellere sürdürülebilir erişim sağlayarak UNCAN.eu araştırma veri platformuna katkıda bulunur.

Kapsam:

Önerilen konu, AB Kanser Misyonu'nun kanser başlangıcı ve ilerlemesinin anlaşılmasını iyileştirme hedefine katkıda bulunacaktır. Bu konu için özellikle çocukluk ve ergenlik kanserleri^[1], sınırlı tedavi seçenekleri olan kanserler, refrakter kanserler, nadir kanserler veya düşük beş yıllık sağkalım oranlarına sahip kanser türleri ilgi çekicidir. Teklifler, uzunlamasına hasta biyolojik örnekleri kullanılarak keşif niteliğindeki mekanistik çalışmaların, klinik kavram kanıtlama çalışmalarının ve/veya yeni toplanan veya mevcut verileri içeren gözlemsel ve translasyonel çalışmaların tasarımını içerebilir. Başvuru sahipleri, hızlı gen dizileme, tek hücre çalışmaları, uzaysal gen haritalaması, uzaysal transkriptomik, epigenetik profilleme, sıvı biyopsiler ve fonksiyonel hassas onkoloji boru hatları dahil ancak bunlarla sınırlı olmamak üzere fonksiyonel genomik^[2] ve yapısal biyolojideki teknolojik gelişmelerden yararlanmaya teşvik edilir. Büyük, karmaşık ve heterojen veri kümelerinin toplanması, görselleştirilmesi, analizi ve yönetimi için nedensel çıkarım, hesaplamalı modelleme ve/veya yapay zeka araçlarının kullanılması teşvik edilir. Sağlık profesyonelleri de dahil olmak üzere farklı bilimsel disiplinler arasında işbirliği öngörülmektedir^[3].

Başvuru sahipleri aşağıdaki faaliyetlerin tümünü ele almalıdır:

• Hastalığın başlangıcı, ilerlemesi ve nüksetmesi üzerindeki tümör zamansal heterojenliğinin fonksiyonel etkilerine erişmek için deneysel modeller^[4] ve teknolojiler geliştirerek yenilikçi terapötik yaklaşımlar için yeni hedefler belirlemek ve doğrulamak.
• Hastalığın başlangıcı ve ilerlemesi sırasında tümörün dinamik çoklu-omik özellikleri, mikro çevresi ve hastaya özgü faktörler^[5] arasındaki etkileşimin altında yatan mekanizmaları araştırmak. Bu, uygun olduğunda klinik verileri kullanarak tedavilere adaptif direncin mekanizmalarını aydınlatmayı içerir^[6].
• FAIR (Bulunabilir, Erişilebilir, Birlikte Çalışabilir, Yeniden Kullanılabilir) çok modlu uzunlamasına hasta verilerini entegre etmek ve analiz etmek için en son yaklaşımları, araçları ve modelleri uygulamak. Bu dijital varlıklar UNCAN.eu araştırma platformu aracılığıyla erişilebilir hale getirilmelidir. Üretilen tüm veri kümeleri, Avrupa Sağlık Veri Alanı'nın AB veri kümesi kataloğunda meta veri kayıtları ile tanımlanmalıdır. Biyobankacılık seçenekleri de dahil olmak üzere yaşam bilimi kaynakları sunan mevcut ESFRI araştırma altyapılarının^[7] katılımı, teklif çalışma planında uygun şekilde yansıtılmalıdır.

Mümkün olduğunca, Avrupa 1M+ Genomları^[8] ve Avrupa Kanser Görüntüleme girişimi^[9] gibi mevcut büyük ölçekli girişimler ve uygun olan diğerlerinden elde edilen verilerden ve deneyimlerden yararlanılmalıdır. Başarılı tekliflerin, UNCAN.eu araştırma platformunu uygulayan UNCAN-CONNECT projesiyle uygun işbirlikleri kurması beklenmektedir^[10]...