Résistance aux antimicrobiens et biosynthèse d'antibiotiques dans les sols : développer une compréhension clé et des stratégies de contre-action en utilisant une approche One-Health

Résultat attendu :

Les activités de ce sujet aideront à progresser vers les objectifs et les cibles de la Mission Soil et de la Stratégie du sol de l'UE pour 2030, du Plan d'action zéro pollution, du Plan d'action européen One Health contre la résistance aux antimicrobiens ainsi que des Objectifs de développement durable^[1].

Les résultats des projets sont censés contribuer à tous les résultats attendus suivants :

• les décideurs politiques, les gestionnaires de terres et les autres parties prenantes concernées ont une meilleure compréhension du développement de la résistance aux antimicrobiens dans les sols, des principaux moteurs et voies de la contribution du sol à l'exposition des humains et des animaux aux gènes et organismes résistants aux antimicrobiens, ainsi que de la biosynthèse des antibiotiques dans les sols ;
• les décideurs politiques et les gestionnaires de terres ont un accès et une capacité accrus pour mettre en œuvre des stratégies fondées sur des données probantes visant à réduire le risque de développement de la résistance aux antimicrobiens dans les sols et à minimiser l'exposition des humains et des animaux aux gènes et organismes résistants aux antimicrobiens ;
• les décideurs politiques et les autres parties prenantes concernées bénéficient d'un meilleur accès à des bases de données enrichies de gènes liés aux antibiotiques et d'alternatives aux antibiotiques provenant de micro-organismes du sol ;
• les citoyens sont plus conscients de l'importance du sol et de la biodiversité du sol pour la santé humaine, animale et environnementale, ainsi que de leur potentiel en tant que source de molécules d'intérêt à des fins pharmaceutiques.

Champ d'application :

La biodiversité du sol joue un rôle majeur dans la santé humaine, animale et des écosystèmes. Les micro-organismes du sol (bactéries et champignons) ont été cruciaux dans la découverte d'antibiotiques utilisés en médecine humaine et vétérinaire. Cependant, les sols peuvent également être un foyer de développement de la résistance aux antimicrobiens et peuvent jouer un rôle clé dans le transfert de gènes de résistance aux antimicrobiens entre les organismes et les compartiments environnementaux. L'utilisation d'antibiotiques devrait augmenter à l'échelle mondiale en raison de la demande croissante d'animaux de production alimentaire, ce qui pourrait exacerber davantage le développement de la résistance aux antimicrobiens dans les sols. Selon l'Organisation mondiale de la santé, la résistance aux antimicrobiens est l'une des plus grandes menaces pour la santé publique^[2]. Les forces motrices du développement de la résistance aux antimicrobiens dans les sols sont toutefois sous-étudiées, tout comme le rôle des sols dans l'exposition des humains et des animaux aux déterminants de la résistance aux antimicrobiens. De plus, nos connaissances sur les gènes liés aux antibiotiques sont actuellement limitées, ce qui rend difficile l'identification de nouveaux composés d'intérêt. Pour mieux comprendre et combattre le développement de la résistance aux antimicrobiens dans les sols, une approche One-Health est nécessaire.

Les propositions doivent :

• explorer la source et la dynamique du développement de la résistance aux antimicrobiens et les mécanismes de biosynthèse des antibiotiques dans les sols à travers tous les types d'utilisation des terres concernés. Le rôle de l'utilisation des terres, des pratiques de gestion des terres et d'autres facteurs de pression environnementaux et anthropiques doit être identifié et pris en compte ;
• analyser le rôle des sols dans le transfert de gènes de résistance aux antimicrobiens entre les organismes et les compartiments environnementaux et dans l'exposition des humains et des animaux aux gènes et organismes de résistance aux antimicrobiens ;
• élargir les bases de données de gènes liés aux antibiotiques et d'alternatives aux antibiotiques provenant de micro-organismes du sol ;
• développer des lignes directrices concrètes pour les décideurs politiques et les gestionnaires de terres afin de : i) mieux traiter l'exposition des humains et des animaux…